En Apocalypto 2, nos reencontramos con Jaguar Paw (Rudy Youngblood) muchos años después de los eventos de la primera película. Habiendo sobrevivido al colapso de la civilización maya y escapado de los sacrificios humanos, ahora vive pacíficamente en la remota jungla con su familia. Sin embargo, su paz se ve destrozada cuando surge una nueva amenaza. Una poderosa tribu del norte, hambrienta de guerra, comienza a invadir las tierras circundantes, buscando reconstruir un nuevo imperio sobre las ruinas de la antigua civilización maya.

Jaguar Paw, ahora más viejo y más sabio, se ve arrastrado de mala gana a volver al conflicto. Cuando su aldea es atacada y muchos de sus habitantes son capturados, incluido su hijo mayor, Jaguar Paw se embarca en un peligroso viaje para rescatarlos. A medida que se adentra más en territorio enemigo, descubre que la tribu invasora ha aprovechado nuevas tácticas y armas brutales. Han adoptado elementos de la crueldad del imperio maya caído, pero son mucho más organizados y letales.

A lo largo de la película, Jaguar Paw se enfrenta a pruebas físicas y emocionales, acosado por visiones de sus antepasados ​​que le advierten del apocalipsis que se avecina. En el camino, forma una alianza con un grupo rebelde formado por supervivientes de varias tribus que también lo han perdido todo a manos de los invasores. Juntos, deben burlar y luchar contra una fuerza mucho mayor mientras Jaguar Paw lucha con sus demonios internos y sus responsabilidades como padre y líder.

El clímax de Apocalypto 2 ocurre durante una batalla épica cerca de un sitio sagrado, donde Jaguar Paw y los rebeldes luchan por defender su tierra y su cultura. En un giro sorprendente, se revela que los invasores han encontrado restos de la antigua tecnología maya capaz de controlar los elementos naturales, lo que conduce a una destrucción masiva y al nacimiento de leyendas sobre los dioses que regresan enojados.

Apocalypto 2 mezcla acción intensa con temas de supervivencia, identidad cultural y el ciclo imparable de la historia, que culminan en una conclusión profundamente emotiva y llena de suspenso.